Совместная циркуляция подлиний 0micr0n BA.4, BA.5 и BA.2.12.1 в США
Теперь у нас достаточно совместной циркуляции подлиний 0micr0n BA.4, BA.5 и BA.2.12.1 в США, чтобы оценить относительную приспособленность этих вирусов. Анализ от Тревора Бедфорда. Собственно он приходит к выводу о прорывных инфекциях и росту показателя Rt.
Линии Pango BA.4 и BA.5, соответствующие кладам @nextstrain 22A и 22B, были впервые описаны в Южной Африке @Tuliodna et al. и обладают ключевыми спайковыми мутациями L452R и F486V.
Первоначальное распространение линии Pango BA.2.12.1, соответствующей кладе @nextstrain 22C, было сосредоточено в Нью-Йорке и на северо-востоке, но с тех пор оно распространилось более широко в США и других странах. Он обладает ключевой спайковой мутацией L452Q.
Ранее мы могли наблюдать относительную приспособленность на основе увеличения частоты BA.4 и BA.5 в Южной Африке и отдельно относительной приспособленности BA.2.12.1 в США. Но сравнения темпов роста частоты в разных регионах не совсем надежны.
В идеале мы хотим сравнить скорость роста частоты в одной и той же географии. Сосредоточившись на США, мы видим, что BA.2.12.1 в настоящее время имеет скорость логистического роста 0,05 в день, а BA.4 и BA.5 имеют темпы логистического роста 0,09 и 0,14 в день.
Это говорит о том, что BA.4 и BA.5 лучше приспособлены, чем BA.2.12.1, как и можно было ожидать, учитывая дополнительную шиповидную мутацию F486V (плюс мутации в других частях генома), и что мы ожидаем, что BA.4 и BA.5 продолжат увеличение частоты на фоне БА.2 и БА.2.12.1.
Мы можем оценить специфичный для варианта Rt, используя метод, разработанный @marlinfiggins ( bedford.io/papers/figgins… ), где мы наблюдаем текущее Rt для BA.2.12.1, равное ~1,0, по сравнению с Rt для BA.4, равное ~1,2 и BA.5 ~1,5.
https://bedford.io/papers/figgins-rt-from-frequency-dynamics/
Это наряду с текущей частотой BA.2.12.1 указывает на то, что рост текущего числа случаев может быть, по крайней мере, частично связан с эпидемией BA.2.12.1, и мы дополнительно наблюдаем рост эпидемий BA.4 и BA.5 в абсолютном количестве случаев. .
Эта картина наблюдается и в других странах, где мы наблюдаем растущие эпидемии BA.2.12.1, BA.4 и BA.5, особенно в Португалии, где BA.5 получила раннее начало и начинает продвигать случаи выше уровня BA.2.
Более подробный график распространения вариантов по странам можно просмотреть на github.com/blab/rt-from-f… , а по штатам — на github.com/blab/rt-from-f… .
rt-from-frequency-dynamic/results/omicro
rt-from-frequency-dynamic/results/omicro
Наблюдается заметное снижение титра нейтрализации против вирусов BA.4 и BA.5 у людей с ревакцинацией и у людей с прорывными инфекциями BA.1 (рисунок Цянь Вана, Дэвида Хо и их коллег biorxiv.org/content/10.110… ).
Подварианты SARS-CoV-2 Omicron BA.2.12.1, BA.4 и BA.5 эволюционировали, чтобы расширить уклонение от антителНа субвариант Omicron BA.2 сегодня приходится подавляющее большинство случаев заражения SARS-CoV-2 во всем мире. Однако его недавние потомки BA.2.12.1 и BA.4/5 резко выросли и стали доминирующими…https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.26.493517v1
Таким образом, мы ожидаем, что по крайней мере часть эпидемий BA.4/BA.5 будет вызвана повышенным прорывом вакцины и увеличением повторного заражения по сравнению с текущей циркуляцией BA.2.
А мы продолжаем настаивать на ранней терапии и профилактики. Быстрый выход из болезни если все делать правильно и вовремя. Подробности по ссылкам ниже.
Примечание: Все сокращение, замены и др. выполнены автором блога и не имеют никакого отношения к публикациям. Сделано это по причине цензуры в некоторых соцсетях, которые борются с любым упоминаем ранней терапии и соответствующих лекарств. (в слове в0кцина не ошибка а «0-ноль» фб стал распознавать сокращение слова)
Отказ от ответственности: я не защищаю читателей, употребляющих иве или какие-либо другие препараты. Я не врач, а биохимик по образованию и никому не даю медицинских советов. Прежде чем принимать какие-либо лекарства, всегда консультируйтесь с лечащим врачом, которому доверяете.
Подписывайтесь на мою страницу, всегда последние РКИ, КИ, обзор мировой прессы, статьи и рекомендации о передовых методах лечения К19 : https://www.facebook.com/veniamin.zaycev/
Здесь собрано все, что будет вам интересно, все объяснено в закрепленном посте, там же есть и схема-таблица с алгоритмом и применении иве:
https://www.facebook.com/ashominfo
Группа в фб «Так победим!» все вопросы по иве и ранней терапии:
https://www.facebook.com/groups/293522279068895
Телеграм-канал «Так победим!» на случай потери связи, там публикуется то, что идет в ЖЖ и не всегда идет в ФБ:
https://t.me/takpobedimsvz
Чат по иве в телеграме:
https://t.me/takpobedi
ЖЖ: https://budetlyanin108.livejournal.com/
И мы продолжаем акцию поддержки замечательного доктора, профессора Поля Марика!
РУБРИКАТОР чата Телеграм-канала «Так победим!»