Откуда появился «странный» Омикрон?
С тех пор, как южноафриканские ученые объявили на прошлой неделе, что они идентифицировали тревожный новый вариант SC0V-2, мир с нетерпением ждал подсказок о том, как он может изменить траекторию пандемии . Но такая же большая загадка - хотя и менее актуальная - заключается в том, где и как эволюционировал Omicron, и какие уроки его появления преподают для предотвращения будущих опасных вариантов.
Очевидно, что Omicron не является результатом одного из более ранних вариантов беспокойства, таких как Alpha или Delta. Вместо этого кажется, что оно развивалось параллельно - и в темноте. «Омикрон» настолько отличается от миллионов геномов SC0V-2, которые были опубликованы, что определить его ближайшего родственника сложно, - говорит Эмма Ходкрофт, вирусолог из Бернского университета. По ее словам, он, вероятно, рано отделился от других штаммов. «Я бы сказала, что это относится к середине 2020 года».
Это поднимает вопрос о том, где более года прятались предшественники Omicron. Ученые видят по существу три возможных объяснения: вирус мог распространяться и развиваться в популяции при небольшом надзоре и секвенировании. Это могло произойти у хронически инфицированного пациента C19. Или он мог развиться в нечеловеческом виде, из которого недавно вернулся обратно в людей.
Кристиан Дростен, вирусолог из университетской клиники Шарите в Берлине, поддерживает первую возможность. «Я предполагаю, что это произошло не в Южной Африке, где проводится большое количество секвенирования, а где-то еще на юге Африки во время зимней волны», - говорит он. «В течение долгого времени происходило множество инфекций, и для того, чтобы этот вид вируса развился, вам действительно нужно огромное эволюционное давление».
Но Эндрю Рамбо из Эдинбургского университета не понимает, как вирус мог так долго скрываться в группе людей. «Я не уверен, что на самом деле есть где-нибудь в мире, достаточно изолированное, чтобы этот вид вируса мог передаваться в течение такого периода времени, не появляясь в разных местах», - говорит он.
Вместо этого Рамбо и другие предполагают, что вирус, скорее всего, развился у хронически инфицированного пациента C19, вероятно, у кого-то, чей иммунный ответ был нарушен другим заболеванием или лекарством. Когда Альфа была впервые обнаружена в конце 2020 года, этот вариант также, казалось, приобрел сразу несколько мутаций, что побудило исследователей постулировать хроническую инфекцию. Идея подкрепляется секвенированием образцов SC0V-2 у некоторых хронически инфицированных пациентов .
«Я думаю, что доказательства, подтверждающие это, становятся все более убедительными, - говорит Ричард Лесселлс, исследователь инфекционных заболеваний из Университета Ква-Зулу-Натал. В одном случае, описанном Лесселсом и его коллегами в препринте , молодая женщина из Южной Африки с неконтролируемой ВИЧ-инфекцией носила SC0V-2 более 6 месяцев. В вирусе накопились многие из тех же изменений, которые наблюдались в вызывающих озабоченность вариантах, такая же картина наблюдалась и у другого пациента, у которого инфекция SC0v-2 сохранялась еще дольше.
Чтобы предотвратить один из возможных источников будущих вариантов, Лесселлс говорит: «Что нам нужно сделать, так это восполнить пробелы в каскаде лечения ВИЧ. Поэтому нам нужно поставить диагноз всем, мы должны привлечь всех к лечению, и нам нужно, чтобы те, кто в настоящее время находится на неэффективном лечении, переходили на эффективные схемы лечения ».
Но Дростен говорит, что опыт лечения хронических инфекций гриппа и других вирусов у пациентов с ослабленным иммунитетом опровергает эту гипотезу для Омикрона. Варианты, которые ускользают от иммунной системы, действительно развиваются у таких людей, но они сопровождаются множеством других изменений, которые делают их менее способными к передаче от человека к человеку. «Эти вирусы очень плохо приспособлены к реальному миру». Это потому, что мутации, позволяющие вирусу выжить у одного человека с течением времени, могут сильно отличаться от тех, которые необходимы для наилучшего распространения от одного человека к другому.
Джессика Меткалф, биолог-эволюционист из Института перспективных исследований в Берлине, не уверена, что это правда в отношении SC0V-2. «Я думаю, что одна из причин, по которой этот вирус так хорошо себя чувствует, заключается в том, что лучшее связывание с ACE2 [его рецептором на человеческих клетках] помогает как распространению внутри хозяина, так и распространению между хозяевами». Тем не менее, на данный момент она соглашается с Дростеном в том, что Омикрон, скорее всего, распространялся и развивался среди скрытой популяции.
Некоторые думают, что вирус мог скрываться в грызунах или других животных, а не в людях, и поэтому испытал различные эволюционные нагрузки, которые привели к появлению новых мутаций. «Геном такой странный», - говорит Кристиан Андерсен, указывая на смесь мутаций, многие из которых ранее не встречались в других вариантах.
«Интересно, насколько это безумно отличается», - говорит биолог-эволюционист Майк Вороби из Университета Аризоны. Хотя он предпочитает человека с ослабленным иммунитетом в качестве источника Омикрона, Вороби отмечает, что согласно недавнему препринту, 80 процентов белохвостых оленей, взятых в Айове в период с конца ноября 2020 года по начало января 2021 года, были инфицированы SC0V-2. «Это действительно заставляет меня задаться вопросом, могут ли другие виды заразиться хронически, что потенциально могло бы обеспечить такое селективное давление с течением времени».
По словам Ариса Кацуракиса, биолога-эволюциониста из Оксфордского университета, еще слишком рано исключать какую-либо теорию о происхождении Омикрона, но он скептически относится к сценарию с животными, учитывая огромное количество человеческих инфекций. «Я бы начал больше беспокоиться о животных-резервуарах, если бы нам удалось подавить вирус, и тогда я мог бы увидеть его как место, где он может спрятаться».
Многие мировые лидеры здравоохранения использовали появление Omicron, чтобы привлечь внимание мира к огромному разрыву между вакцинацией C19 в более богатых и более бедных странах. Ричард Хатчетт, глава Коалиции за инновации в обеспечении готовности к эпидемиям, начал свое выступление на Всемирной ассамблее здравоохранения в понедельник, сказав, что низкий охват вакцинацией в Южной Африке и Ботсване «создал благоприятную среду» для развития этого варианта. «Глобальное неравенство, которое характеризовало глобальную реакцию, теперь вернулось домой», - сказал он.
Однако, по словам некоторых ученых, существует мало доказательств, подтверждающих это утверждение. «Идея о том, что если бы мы больше вакцинировались в Африке, у нас бы этого не было: я бы хотел, чтобы это было правдой, но у нас буквально нет возможности узнать», - говорит Кацуракис. На данный момент уроки, которые следует извлечь из Омикрона, остаются такими же неизвестными, как и его происхождение.
Примечание: Все сокращение, замены и др. выполнены автором блога и не имеют никакого отношения к публикациям. Сделано это по причине цензуры в некоторых соцсетях, которые борются с любым упоминаем ранней терапии и соответствующих лекарств.
Подписывайтесь на мою страницу, всегда последние РКИ, КИ, обзор мировой прессы, статьи и рекомендации о передовых методах лечения К19 : https://www.facebook.com/veniamin.zaycev/
Здесь собрано все, что будет вам интересно, все объяснено в закрепленном посте, там же есть и схема-таблица с алгоритмом и применении иве:
https://www.facebook.com/ashominfo
Группа в фб «Так победим!» все вопросы по иве и ранней терапии:
https://www.facebook.com/groups/293522279068895
Телеграм-канал «Так победим!» на случай потери связи, там публикуется то, что идет в ЖЖ и не всегда идет в ФБ:
https://t.me/takpobedimsvz
Чат по иве в телеграме:
https://t.me/takpobedi
ЖЖ: https://budetlyanin108.livejournal.com/
И мы продолжаем акцию поддержки замечательного доктора, профессора Поля Марика!
РУБРИКАТОР чата Телеграм-канала «Так победим!»