budetlyanin108

Categories:

Анализ in silico 173 соед. показывает, что IVM обладает наивысшим сродством связывания с SARS-CoV2

#ivermectin 

Исследования in silico выбранных множественных лекарственных средств нацеливания на РНК-зависимые РНК-полимеразные белки 3CLpro и nsp12 SARS-CoV-2 и SARS-CoV

В нашем исследовании молекулярного докинга in silico были проверены в общей сложности 173 соединения, включая одобренные FDA противовирусные препараты, с хорошими дескрипторами ADME и некоторые другие аналоги нуклеотидов. Результаты показывают , что эти соединения демонстрируют сильную аффинность связывания в отношении остатков на активных участках РНК-зависимой РНК-полимеразы (RdRp) моделируемых структур и химотрипсина - как цистеин - протеазы (3CLpro) белков HCoV. Свободные энергии (Δ Gs) связывания для SARS-CoV-2 и SARS-CoV RdRp составляет от - 5,4 до - 8,8 ккал / моль и от - 4,9 до - 8,7 ккал / моль, соответственно. Кроме того, SARS-CoV-2 и SARS-CoV 3CLpro дали Δ Gзначения варьируются от - 5,1 до - 8,4 ккал / моль и от - 5,5 до - 8,6 ккал / моль соответственно. Интересные результаты получены для ивермектина, противопаразитарного агента с широким спектром активности, который дал наивысшее значение энергии связывания (-8,8 ккал / моль) против 3CLpro SARS-CoV-2 и RdRps как SARS-CoV, так и SARS-CoV- 2. Причина таких высоких значений энергии связи, вероятно, связана с присутствием в его структуре гидрокси-, метокси- и сахарных фрагментов. Стабильность протеин-лигандных комплексов ингибиторов полимеразы, рассматриваемых в данном исследовании, таких как софосбувир, ремдесивир, тенофовир, рибавирин, галидесивир, 5c3, 5h1 и 7a1, демонстрирует сильное или умеренное водородное связывание и гидрофобные взаимодействия (π – π сложенные, π –Π Т-образный, π-сигма и π-алкил). Стабильность, обеспечиваемая такими взаимодействиями, приводит к большей противовирусной активности или ингибирующему эффекту лигандов. Оценка средней свободной энергии связывания одобренных FDA лекарств очень сопоставима для конформеров конкретного ингибитора, что указывает на аналогичные способы связывания внутри карманов.

ссылка здесь: https://www.facebook.com/veniamin.zaycev/posts/4718246931543362

Error

Anonymous comments are disabled in this journal

default userpic

Your reply will be screened

Your IP address will be recorded