budetlyanin108

Categories:

Будет ли SARS-CoV-2 вести себя как грипп и потребует ли обновлений вакцины?

Думаю надо разобрать важный вопрос связанный с вакцинацией. Этим вопросом я озадачился еще весной. А что мы будем делать когда произойдет антигенный сдвиг или дрейф у SARS-CoV-2? На этот вопрос ничего вразумительного не было. Но все РНК-вирусы эволюционируют чрезвычайно быстро, но некоторые из них, такие как грипп, способны принимать мутации в своих поверхностных белках таким образом, что они могут частично ускользать от человеческого иммунитета. Этот процесс известен как «антигенный дрейф». Разобраться с этим нам поможет кроме меня и Тревор Бедфорд Доцент Отделения вакцин и инфекционных заболеваний, Фред Хатч Доцент Отделения наук о общественном здоровье, Фред Хатч Доцент Отделения биологии человека, Фред Хатч Доктор Тревор Бедфорд использует мощные компьютеры и сложные статистические методы для изучения быстрого распространения и эволюции вирусов, в том числе вызывающих COVID-19, грипп, Эбола и Зика. Данные, собранные в результате этих процессов, помогают исследователям разработать успешные стратегии мониторинга и контроля инфекционных заболеваний. Его визуальные представления вирусных генеалогических деревьев используются, чтобы показать, как судьба опасных вспышек часто определяется генетикой возбудителя инфекции, поведением человека и географией. Доктор Бедфорд применил эти методы, чтобы задокументировать всемирное распространение COVID-19 и вирусов сезонного гриппа. Он разрабатывает модели, позволяющие предсказать, какие штаммы гриппа могут быть наиболее опасными для человека, - данные, которые помогают принимать важные решения на раннем этапе о том, какие штаммы включать в ежегодные прививки от гриппа. Он специализируется на отслеживании эволюционных изменений вирусов, таких как ВИЧ и грипп, которые используют РНК, а не ДНК, для передачи своей генетической информации. РНК-вирусы гораздо более склонны к быстрой мутации, что делает многие из них особенно проворными в ускользании от иммунной системы человека и их трудно остановить с помощью вакцин. Он стал соавтором платформы с открытым исходным кодом Nextstrain, которая обеспечивает постоянно обновляемое представление общедоступных данных вирусного генома наряду с мощными инструментами анализа и визуализации. Он является ведущим сторонником немедленного выпуска результатов исследований, посвященных анализу эволюции вирусов во время эпидемий, свежей информации, которая может спасти жизнь людей. РНК-вирусы гораздо более склонны к быстрой мутации, что делает многие из них особенно проворными в ускользании от иммунной системы человека и их трудно остановить с помощью вакцин. Так вот. Что касается гриппа, это требует регулярного обновления вакцины, чтобы не отставать от растущей популяции вируса. Другие РНК-вирусы, такие как кори, быстро мутируют, но не могут изменить структуру белка, чтобы избежать иммунитета, и поэтому эти вакцины не нуждаются в обновлении, -говорит Др.Т.Бедфорд Был открытым вопрос о том, в какой степени SARS-CoV-2 будет вести себя как грипп и потребует обновлений вакцины. Однако появляющиеся данные свидетельствуют о вероятности дрейфа антигенов. Во-первых, у нас есть новые исследования антигенного дрейфа сезонных коронавирусов. Кэти Кистлер и я показали обширную адаптивную эволюцию шиповых белков вирусов OC43 и 229E, согласующуюся с антигенным дрейфом, продолжает Тревор (см. рис1)Сама работа здесь: https://bedford.io/papers/kistler-hcov-adaptive-evolution/Теперь у нас также есть прямые серологические доказательства дрейфа антигенов в 229E от Джессики Блум, Е.Речил и др. вчера ставил и разбирал эту важную работу. Так вот. Они показывают что повторное заражение сезонными коронавирусами, которое происходит каждые ~ 3 года, отчасти связано с эволюцией вируса. Что касается SARS-CoV-2, мы ожидаем, что антигенные варианты распространятся только после того, как будет инфицировано достаточное количество людей, чтобы дать этим вариантам преимущество передачи, полученное благодаря способности повторно инфицировать некоторую часть людей, иммунных к исходному варианту. На данный момент во многих странах инфицировано от 10% до 20% населения и поэтому мы ожидаем некоторого слабого эволюционного давления для антигенного дрейфа. О серопревалентности по странам здесь:https://www.medrxiv.org/con.../10.1101/2020.12.01.20241539v1Теперь мы наблюдаем появление и распространение нескольких вариантов, которые могут иметь некоторое антигенное действие. Эти варианты обычно маркируются на основе мутации белка шипа SARS-CoV-2. Например, N439K имеет замену аспарагина на лизин (K) в сайте 439 в спайке. Этот вариант N439K сейчас присутствует в ~ 5% недавних вирусов из Европы и демонстрирует доказательства ускользания от некоторых моноклональных антител и снижения реактивности к некоторым сывороткам выздоравливающих (см.рис2)Недавние объявления были сосредоточены на распространении N501Y в Великобритании и независимое появление и распространение N501Y в Южной Африке Британский вариант, в частности, имеет несколько мутаций, которые представляют биологический интерес и заслуживают пристального внимания. По Великобритании можно посмотреть работу здесь: https://virological.org/.../preliminary-genomic.../563Независимое возникновение и распространение вариантов свидетельствует о естественном отборе, где в дополнение к N501Y мы видим, например, независимое появление S477N в Европе и в Австралии Др. Эмма Ходкрофт ведет список представляющих интерес мутаций с соответствующими nextstrainмнения и соответствующие публикации на: https://github.com/.../cluster_scripts/blob/master/README.mdВсе это говорит о том, что меня не беспокоит, что эти варианты значительно снизят эффективность вакцины при развертывании в 2021 году. Большинство циркулирующих вирусов SARS-CoV-2 не имеют мутаций в домене связывания шипового рецептора. Кроме того, одиночные мутации, как правило, будут иметь небольшое влияние на поликлональные иммунные ответы, а сильный иммунный ответ на мРНК-вакцины предполагает, что для значительного снижения эффективности потребуется большое антигенное изменение. Тем не менее, мы можем увидеть небольшое снижение эффективности вакцины из-за дрейфа антигенов, и, вероятно, в ближайшие годы нам потребуется процесс обновления спайкового варианта, используемого в вакцине, для наилучшего соответствия циркулирующим вирусам. Забегая вперед, я предлагаю:  1. Новые варианты должны быть проанализированы против сыворотки выздоровевших и вакцинированных лиц для проверки антигенных эффектов.  2. Записи иммунизации должны быть связаны с геномным надзором для выявления вариантов, вызывающих прорывные инфекции. 

Вопрос: проводят ли производители вакцин геномику участников клинических испытаний? Возможно ли, что кто-либо из инфицированной группы с вакциной был инфицирован мутировавшим штаммом?

Ответ здесь: https://www.facebook.com/veniamin.zaycev/posts/4431090006925724

Error

Anonymous comments are disabled in this journal

default userpic

Your reply will be screened

Your IP address will be recorded