Кол-ная оценка распространения SARS-CoV-2 в Швейцарии на основе данных геномного секвенирования

Количественная оценка распространения SARS-CoV-2 в Швейцарии на основе данных геномного секвенирования

Геномы патогенов дают представление об их эволюции и распространении эпидемии. Мы секвенировали 1439 геномов SARS-CoV-2 из Швейцарии, что составляет 3-7% всех подтвержденных случаев в неделю. Используя эти данные, мы демонстрируем, что ни одна линия не стала доминирующей, что свидетельствует против эволюции в сторону общей более низкой вирулентности. На эпидемиологическом уровне мы не сообщаем никаких доказательств скрытой передачи до первого подтвержденного случая. Мы находим много ранних вирусных представлений из Германии, Франции и Италии, а также множество недавних представлений из Германии и Франции. Летом мы количественно оцениваем количество не отслеживаемых инфекций, вызванных интродукциями, определяем эффективное репродуктивное число и оцениваем степень недостаточной выборки.

ссылка здесь: https://www.facebook.com/veniamin.zaycev/posts/4283654818335911