budetlyanin108

Categories:

Обширное генетическое разнообразие и диапазон хозяев коронавирусов, переносимых грызунами

Чтобы лучше понять генетическое разнообразие, ассоциацию хозяев и эволюцию коронавирусов (CoV) в Китае, мы проанализировали в общей сложности 696 грызунов 16 различных видов, отобранных в провинциях Чжэцзян и Юньнань. На основе CoV скрининга CoV в образцах фекалий на основе обратной транскриптазы на основе ПЦР и последующего анализа последовательности гена RdRp, мы идентифицировали CoV у различных видов грызунов, включая Apodemus agrarius, Apodemus latronum, Bandicota indica, Eothenomys miletus, E. eleusis, Rattus andamanesis. , Rattus norvegicus и R. tanezumi. Apodemus chevrieri был особенно богатым хозяином, укрывавшим 25 CoV грызунов. Генетический и филогенетический анализ выявил наличие трех групп CoV, переносимых рядом грызунов, которые были тесно связаны с коронавирусом крыс Lucheng Rn (LRNV), Коронавирус китайской ратуши HKU24 (ChRCoV_HKU24) и коронавирус крыс Longquan Rl (LRLV) идентифицированы ранее. Один недавно идентифицированный вирус, связанный с A. chevrieri, тесно связанный с LRNV, не имел гена NS2. Этот вирус имел генетическую организацию, аналогичную AcCoV-JC34, недавно обнаруженному у того же вида грызунов в Юньнани, что позволяет предположить, что он представляет собой новый подтип вируса. Примечательно, что были идентифицированы дополнительные варианты LRNV, которые содержали предполагаемые неструктурные гены NS2b, расположенные ниже гена NS2, которые, вероятно, происходили из генома хозяина. События рекомбинации также были идентифицированы в гене ORF1a Lijiang-71. В целом, эти данные показывают существенное генетическое разнообразие и геномную сложность вирусов, переносимых грызунами, и значительно расширяют наши знания об этих основных резервуарах вирусов дикой природы.

ссылка: https://www.facebook.com/veniamin.zaycev/posts/4055989107769151

Error

Anonymous comments are disabled in this journal

default userpic

Your reply will be screened

Your IP address will be recorded